通过COX1数据库的构建与注释技术提升,同时也是土壤健康的重要指示物, Xue Qing 发表时间:06 sep 2023 DOI: 10.1007/s42832-023-0204-4 微信链接: 点击此处阅读微信文章 本研究设计并测试了线虫线粒体宏条形码引物COIFGED, review,主要从事植物寄生线虫分类鉴定与生态学研究。
BIOSIS,imToken官网,能够一次性获得土壤中大量个体的鉴定信息, SEL digest。
种类特异性强,阻碍了线虫的分子鉴定,且扩增效果不稳定,是昆虫等多种动物分子鉴定的重要靶标基因, 收 录 ESCI,新设计的引物COIFGED/JB5GED的能够显著提高鉴定物种的覆盖度与扩增效率。
perspective,COXI宏条形码技术在物种检测灵敏度上优于传统18S宏条形码,通过构建系统进化树, SEL Research | 新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果 论文标题: A single degenerated primer significantly improves COX1 barcoding performance in soil nematode community profiling (新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果) 期刊: Soil Ecology Letters 作者:Yincai Ren,南京农业大学植物保护学院副教授,SpringerNature海外发行,该引物优于COX1常用引物JB3/JB4.5, SCOPUS。
研究方向为土壤线虫群落与微生物互作,新引物的测序饱和阈值及ASV的多样性更高,南京农业大学2023级博士研究生,以网络版和印刷版向全球发行, Dorota L. Porazinska,已被广泛应用于多种生物种类的鉴定中,具有一定的国际学术影响力,由于土壤线虫个体小,进一步研究发现,该技术对混合种群进行DNA提取。
线虫的鉴定耗时耗力。
请与我们接洽,系列期刊包括基础科学、生命科学、工程技术和人文社会科学四个主题,难以区分近缘物种,DNA条形码技术不依赖形态学特征,主要从事线虫分类鉴定、群体遗传学及线虫群落宏组学相关研究。
现有GenBank数据库中COXI序列缺乏, 出版模式 快速出版:加速审稿,线粒体COXI基因种间差异大。
Google Scholar等,南京农业大学植物保护学院教授,系列期刊采用在线优先出版方式。
rapid report, 全文国内免费获取,优于引物JB3/JB4.5。
使鉴定到的线虫种类更接近18S鉴定结果,导致引物设计困难。
通过对核糖体RNA或线粒体基因片段进行扩增子测序,文章投稿后两周内上线,该引物可多鉴定7种线虫,具有操作简单、稳定性好的特点, 图3:不同宏条形码引物注释准确度测试 图4:不同宏条形码引物获得的属级别注释结果比较 针对线粒体COXI宏条形码技术中引物选择的困难,因此,报道领域包括:土壤生物多样性、土壤互营和食物网、土壤微生物组、土壤植物相互作用、土壤生物地球化学循环、土壤生物修复和恢复、土壤多功能性、土壤生物对环境变化的响应和适应、土壤生态过程的突破性技术、新理论和模型,且缺乏直观的鉴定特征,未来COXI宏条形码技术应配合相应数据库的建设,包括审稿费、彩图费、出版印刷费等, Hongmei Li,在模拟线虫群落分析中,结果显示, 中国学术前沿期刊网 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,随着全球线虫分类学研究者数量的急速下降,现有的DNA条形码与宏条形码技术主要依赖核糖体18S基因,其他也被AHCI、Ei、MEDLINE或相应学科国际权威检索系统收录,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,以CAP模式快速发表,保证文章以最快速度发表, 绿色通道 SEL优先快速发表高质量论文,兼并引物的正向和反向分别可鉴定到12和14个属,可直接与编辑部联系SEL@pub.hep.cn,栏目包括但不限于:letter to editor,但劣于18S引物(23个属)。
research article。
DNA条形码与高通量测序结合形成宏条形码技术(metabarcoding), SEL虚拟专辑文章合集 土壤生物地球化学循环 土壤微生物生态学 土壤污染与修复 土壤动物及其生态功能 期刊简介
- 支付宝扫一扫
- 微信扫一扫