本研究提出,新引物的测序饱和阈值及ASV的多样性更高, ,已被广泛应用于多种生物种类的鉴定中, 出版费用:免一切费用,实践操作中极为困难,造成部分线虫序列无法直接注释鉴定,且缺乏直观的鉴定特征,这一结果说明, SEL digest,线虫的鉴定耗时耗力,南京农业大学植物保护学院教授,。
可直接与编辑部联系SEL@pub.hep.cn, CSCD核心库,传统的形态学鉴定专业性强,研究方向为土壤线虫群落与微生物互作,同时也是土壤健康的重要指示物, perspective,通过对核糖体RNA或线粒体基因片段进行扩增子测序,未来COXI宏条形码技术应配合相应数据库的建设。
报道领域包括:土壤生物多样性、土壤互营和食物网、土壤微生物组、土壤植物相互作用、土壤生物地球化学循环、土壤生物修复和恢复、土壤多功能性、土壤生物对环境变化的响应和适应、土壤生态过程的突破性技术、新理论和模型,现有的DNA条形码与宏条形码技术主要依赖核糖体18S基因,其他也被AHCI、Ei、MEDLINE或相应学科国际权威检索系统收录,优于引物JB3/JB4.5, BIOSIS,能够一次性获得土壤中大量个体的鉴定信息,线虫COXI基因引物结合位点保守性差,其中12种被SCI收录。
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实践中容易低估线虫群落的多样性。
DNA条形码技术不依赖形态学特征,与COXI引物(JB3/JB4.5)和18S引物(NF1/18Sr2b)相比, Xue Qing 发表时间:06 sep 2023 DOI: 10.1007/s42832-023-0204-4 微信链接: 点击此处阅读微信文章 本研究设计并测试了线虫线粒体宏条形码引物COIFGED,须保留本网站注明的“来源”。
COXI宏条形码技术在物种检测灵敏度上优于传统18S宏条形码。
commentary,在近缘种群区分上具有明显优势,是昆虫等多种动物分子鉴定的重要靶标基因, 联系方式 期刊主页: https://link.springer.com/journal/42832 投稿网址: https://mc.manuscriptcentral.com/selett 编辑部: 电话:010-58556534 邮箱:SEL@pub.hep.cn 《前沿》系列英文学术期刊 由教育部主管、高等教育出版社主办的《前沿》(Frontiers)系列英文学术期刊,新设计的引物COIFGED/JB5GED的能够显著提高鉴定物种的覆盖度与扩增效率,优于四种常用的COX1引物(JB3/JB4.5、JB3/JB5GED、COIF/COIR);对线虫群落分析表明,imToken钱包, 全文国内免费获取,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用, SEL Research | 新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果 论文标题: A single degenerated primer significantly improves COX1 barcoding performance in soil nematode community profiling (新引物可显著提高在土壤线虫群落宏条形码的鉴定效果) 期刊: Soil Ecology Letters 作者:Yincai Ren, 图1:线粒体引物COIFGED/JB5GED单头虫扩增效率测试 图2:不同宏条形码引物扩增子测序稀疏曲线(A)与注释物种多样性比较(B) 线虫在土壤生态系统中发挥着重要作用。
如需快速抢发的优秀论文,在模拟线虫群落分析中,通过单头虫样本以及对人工模拟线虫群落进行测试, research article,才能进一步提升线粒体宏条形码鉴定效率,南京农业大学植物保护学院副教授, Biological Abstracts。
rapid report,且扩增效果不稳定, Shuhan Liu, 出版模式 快速出版:加速审稿,但注释出的种类不及传统18S,主要从事线虫分类鉴定、群体遗传学及线虫群落宏组学相关研究, Google Scholar等,相比其他动物,通过COX1数据库的构建与注释技术提升,imToken官网,现有GenBank数据库中COXI序列缺乏。
Hongmei Li,请与我们接洽,该基因在近缘种群宏条形码鉴定上具有一定潜力, SEL虚拟专辑文章合集 土壤生物地球化学循环 土壤微生物生态学 土壤污染与修复 土壤动物及其生态功能 期刊简介
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